Das Herz der Stadt bildet der Dom von San Lorenzo, die große tausendjährige Basilika, wo die Aschen des Heiligen Johannes des Täufers, Schutzpatron der Stadt, aufbewahrt werden. Mitgebracht wurde die Asche von den Genuesen bei der Rückkehr aus dem ersten Kreuzzug (1098) zusammen mit dem Sacro Catino, eine Glasschale, die lange Zeit als der mythische Heilige Gral galt und im Museum des Domschatzes bewundert werden kann. Das Innere der Kathedrale zeugt von der politischen und religiösen Verflechtung, die immer die Grundlage der Genueser Geschichte bildete. Interessant ist auch das Diözesanmuseum, wo außer dem romanischen Kreuzgang der Domherren die Vorläufer der Jeans zu sehen sind, deren Name in Genua seinen Ursprung hatte.
Die Stätten der Frömmigkeit sind in dieser Stadt sehr zahlreich, mehr als neunzig Kirchen, von denen viele Adelsfamilienkirchen sind, die meisten befinden sich in der Altstadt längs der alten Straßen außerhalb der mittelalterlichen Mauern: barocke Schätze wie San Siro oder die Jesuitenkirche Chiesa del Gesù, Zeugen der Geschichte wie Santa Maria di Castello oder die Commenda von Prè.